Гидробиологический музей был образован в 1928 году и существует по настоящее время. Общая площадь музея более 200 квадратных метров, на которой экспонируется около 2 500 экспонатов. Музей внесен в Государственный регистр баз данных российской сети культурного наследия, всероссийский реестр музеев, о чем получен регистрационный сертификат.